中国边境，午夜，人蛇头目绰号“蛇王”的金耀华组织的人蛇趁着恶劣气候由远洋船实施偷渡，边防总队边境调查大队大队长贝兆祥获知情报，带小分队进行拦截，突遇天气巨变。偷渡客被残忍杀害，案情直接惊动公安部。
公安部严令边防总队限时破案，贝兆祥临危受命，组成专案组，代号“捕蛇行动”全面追捕涉案人蛇，正当案情面临得大突破，却突然遭遇黑暗势力，案件不得不面临搁浅。